Autentisering av muscellinje (kort tandemrepetition (STR))
Med tanke på förekomsten av korskontaminering och felidentifiering är äktheten hos de celler som används i vetenskapliga forskningsprojekt ett stort problem. Det uppskattas att cirka 15-20% av all cellinjebaserad forskning sker med felidentifierade cellinjer. Att fastställa en cellinjes profil med hjälp av STR-analys är därför avgörande för att kunna utföra tillförlitlig och repeterbar forskning. Dessutom kräver ett växande antal tidskrifter cellinjeverifiering innan de accepterar en artikel.
Vår tjänst omfattar
- Autentisering av cellinje
- Jämförelse med onlinedatabaser
- Publiceringsfärdig analysrapport
Lätt att använda
- Ladda ner beställningsformuläret för cellinjeautentisering och lägg till det ifyllda och utskrivna bladet i din provförsändelse.
- Skicka proverna till oss i ett vadderat kuvert i rumstemperatur.
- För gDNA ska du skicka oss ≥ 50 μl av 50ng/μl gDNA i Tris eller EDTA (10 mM Tris, 0,1 mM EDTA).
- För cellpellets, vänligen förse oss med 1,0-5,0 miljoner celler som en cellpellet. Tvätta två gånger med PBS och resuspendera i 0,5 ml 70-90% etanol.
Markörer
- Humana celler typas med PowerPlex System från Promega med hjälp av 16 STR-markörer.
- Musceller typas med 18 STR-markörer.
- Råttceller typas med 14 STR-markörer och en könsspecifik markör.
- Hundceller är typade med 11 STR-markörer.
- Hamsterceller är typade med 10 STR-markörer.
Resultat
Du kommer att få resultaten inom 2 veckor per e-post. Resultaten inkluderar jämförelsen av data med Cellosaurus-databasen. Cellinjen kommer att klassificeras som autentiserad eller felidentifierad.
Korta tandemrepetitioner (STR)
Ett DNA-motiv med 2-13 baser som upprepas upp till flera hundra gånger utgör en kort tandemrepetition (STR). Individuell variation i antalet repetitioner i en STR leder till variationer i längden på de fragment som produceras vid PCR. Cellinjerna profileras med hjälp av dessa variationer i fragmentlängder vid flera loci.
Detektion av blandningar av cellinjer
Det är möjligt att identifiera kontaminering av en cellinje med en eller flera ytterligare cellinjer ned till en frekvens på 10% av den kontaminerande cellinjen. Kombinationer av cellinjer ger vanligen STR-profiler med tre eller fler toppar för en enda eller flera loci.