マウス細胞株認証(ショートタンデムリピート(STR)
クロスコンタミネーションや誤認識の蔓延を考えると、科学研 究プロジェクトで使用される細胞の真正性は大きな懸念事 項である。細胞株を用いた研究の約15~20%は、誤認された細胞株を用いて行われていると推定されている。したがって、STR解析を用いて細胞株のプロファイルを決定することは、信頼性が高く再現性のある研究を実施する上で極めて重要である。さらに、論文を受理する前に細胞株の検証を要求するジャーナルも増えています。
当社のサービスには以下が含まれます。
- 細胞株の認証
- オンラインデータベースとの比較
- 出版準備の整った分析レポート
簡単な操作
- 細胞株認証オーダーフォームを ダウンロードし、 必要事項をご記入の上、印刷したシートをサンプル発送の際に同封してください。
- サンプルは室温で封筒に入れてお送りください。
- gDNAの場合は、50ng/μlのgDNAをTrisまたはEDTA(10mM Tris、0.1mM EDTA)に溶解したものを50μl以上お送りください。
- 細胞ペレットの場合、100万~500万個の細胞を細胞ペレットとしてご提供ください。PBSで2回洗浄後、0.5 mlの70-90%エタノールに懸濁してください。
マーカー
- ヒト細胞はプロメガ社のPowerPlexシステムで16種類のSTRマーカーを用いてタイピングされます。
- マウス細胞は18のSTRマーカーを用いてタイピングする。
- ラット細胞は14のSTRマーカーと1つの性特異的マーカーでタイピングする。
- イヌの細胞は 11 STR マーカーでタイピングされている。
- ハムスター細胞は10個のSTRマーカーでタイピングされている。
結果
結果は2週間以内にEメールでお送りします。結果には、セロサウルス・データベースとの比較が含まれます。細胞株は真正か誤認かに分類されます。
ショートタンデムリピート(STR)
最大数百回繰り返される2-13塩基のDNAモチーフがショートタンデムリピート(STR)を構成する。STRの繰り返し数には個人差があり、PCRを用いた場合、生成される断片の長さにばらつきが生じる。細胞株は、いくつかの遺伝子座における断片長のこれらのばらつきを用いてプロファイリングされる。
細胞株混合物の検出
汚染細胞株の頻度が10%以下であれば、1つの細胞株が1つ以上の細胞株によって汚染されていることを同定することが可能である。細胞株の組み合わせは通常、単一または複数の遺伝子座について3つ以上のピークを持つSTRプロファイルを提供する。